IP SURVEYOR THE WEBにファイルがアップロードできない場合、
原因は2つ考えられます。

ファイルサイズの上限

Web版IP SURVEYORは1ファイルにつき32MBまで有効になります。
単純計算にはなりますが、200万IPまでは
1ファイルに収めることができることになります。

Web版IP SURVEYORは
並行してIPリストをアップすることも可能です。

文字コードの指定

IP SURVEYORは「ASCII」「シフトJIS」「UTF-8」「EUC-JP」のいずれかしか対応していません。
文字コードを上記のいずれかに変更後、再度実施してください。